番茄幼苗在温度低、水分足、氮肥多的条件下，花芽易过度分化并形成多心皮的畸形花，后续所结果实呈桃形、扁形、瘤形、指形，无完整外果皮。
番茄幼苗苗龄过长且长期处于低温、干旱、少肥、缺硼的环境下时，花器易木栓化，一旦条件合适，木栓化组织无法跟上内部组织的生长速度，从而导致果实开裂并形成裂果、疤果或露籽果。
一、越冬耐寒番茄种子畸形的原因
1、相对于辣椒、茄子来说，番茄是茄果类蔬菜中容易受环境影响而发生畸形果的。番茄果实发育成优质果还是畸形果，取决于花芽分化的质量。
2、在冬季番茄大约30天左右，幼苗长出2-3片真叶，此时穗花的花芽开始分化，第35-40天后，开始第二花序的花芽分化，到第60-65天时，第三花序也已经开始分化，此时幼苗已具有7-8片真叶，花序已经现蕾或者即将开花。
3、若从定植至点穗花期间，温度、水肥管理不当，不可满足花芽分化所需的适宜条件，就会大大增加畸形果的发生几率。如果一旦引起花芽分化不良，后期分化出畸形花。
4、番茄幼苗在温度低、水分足、氮肥多的条件下，花芽容易过度分化，形成多心皮的畸形花，将来所结的果实必然呈桃形、扁形、瘤形、指形等奇形怪状，通常没有完整的外果皮。
5、另外一种情况是，番茄幼苗苗龄过长，而且长期处于低温、干旱、少肥、缺硼的条件下，花器容易木栓化，一旦条件适宜，木栓化的组织赶不上内部组织的生长速度，就会导致果实开裂，形成裂果、疤果或露籽果，这类畸形果的外果皮缺失一部分或大部分，失去商品性。
6、所以，在西红柿花芽形成过程中，经历的低温时间越长，所形成的畸形花就越多。所以预防越冬耐寒番茄畸形果，首要关键是幼苗期温度调控，其次是水分、肥料等。
二、怎么防止越冬耐寒番茄前期产生畸形果
1、加强温度调控
建议白天棚内温度控制在20-25℃，上半夜温度保持在14-18℃，下半夜温度控制在10-13℃，拉大昼夜温差，花芽分化进行速度快。
2、注意水分管理
选择晴天移栽，定植水要浇透，促进根系尽快适应土壤环境；缓苗水要根据土壤墒情及天气情况，并且在尽可能不影响地温的前提下，酌情浇灌，搭配冲施果利多等养根的肥料。
3、合理用肥
定植的西红柿底肥氮肥偏高，容易造成幼苗徒长，所以缓苗后以控温控水为主，抑制过旺长势，同时叶面喷施白糖或葡萄糖等，调节植株碳氮比。为预防缺硼引起的花芽分化不良，建议幼苗期定期喷施光合动力、硼尔美等含硼叶面肥。
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